Y型過濾器的核心為二根管路，在其中安裝了濾網，其過濾作用關鍵來源于濾網。清洗Y型過濾器時，**必須清洗濾網。具體做法是立即拆下濾網用自來水清洗，假如濾網毀壞，可以考慮到立即拆換。

在一些黏性液態運送管路中，Y型過濾器的內腔常常沾有很多雜質，只靠清洗濾網是難以做到清洗實際效果的。這時，必須將Y型過濾器從系統中所有拆下，用髙壓灑水或噴氣式飛機清洗管路內部結構。

Y型過濾器在各種各樣操作系統中起著分離和過濾的功效。長期性應用后，非常大一部分雜質必定會在內部結構累積。這時必須清洗Y型過濾器，清洗后的Y型過濾器可以再度完成其優良的過濾特性。